天昊生物多年专注于深耕遗传学和基因组学等领域科研特色技术的开发,不断跟进国际先进的科研成果及技术发展,创新研发了许多特色专利技术和领域内前沿的检测服务项目,受到广大专业科研用户的认可和好评。
上海天昊生物科技有限公司开发的AccuCopy®多重DNA拷贝数检测技术(专利号:201010180551.2),根据客户项目要求合成特异引物和竞争模板,以及优化PCR反应体系后组装而成。该专利技术原理说明见下图:取一定量的竞争DNA片段混合物----每个片段与各自对应基因片段仅有微小差别(通常为几个碱基长度差异),然后与合适量的样本DNA混合,作为随后多重荧光竞争性PCR扩增的模板;多重PCR产物经毛细管电泳后对不同基因位点扩增产物以及同一位点的不同模板(样本DNA与竞争DNA)扩增产物根据其长度差异进行分离;分析每个基因片段的S/I值,利用参照基因S/I值对目标基因S/I值进行校正后获取目标基因的准确拷贝数。与其它拷贝数检测技术如qRT-PCR和MLPA相比,该检测专利技术具备低成本、高效率、高准确性的优势。PCR扩增产物用ABI3130XL进行毛细管电泳,原始数据文件采用GeneMapper4.0(Life technologies)进行目标峰高及峰面积数据读取,输出数据采用excel进行处理分析。
AccuCopy®多重DNA拷贝数检测技术原理:利用内对照DNA校正不同片段的扩增效率的差异,参照基因R来作为2拷贝的内参基因,用于拷贝数绝对定量。数据处理时,使用目的峰面积S/内对照DNA峰I,再用参照基因R进行标化2拷贝,目的基因片段的拷贝数便可以精确定量了。如下图所示:
技术路线:
样本类型:完整无污染的基因组DNA
样本浓度:浓度≥ 10 ng/μL
样本纯度:OD260/280介于1.8-2.0,OD260/230 ≥ 1.0
样本需求量:每个待实验片段(包括内参)需要100 ng DNA
图 不同目标片段荧光信号强度
AccuCopy®部分客户文章:
英文标题 | 中文标题 | 杂志 | 年份 |
The characteristics and spectrum of F9 mutations in Chinese sporadic haemophilia B pedigrees | 中国散发性B型血友病家系F9突变特征及图谱 | Haemophilia | 2019 |
Copy number variations and polymorphisms in HSP90AB1 and risk of systemic lupus erythematosus and efficacy of glucocorticoids | HSP90AB1拷贝数变异和多态性与系统性红斑狼疮的风险及糖皮质激素的疗效 | Journal of Cellular and Molecular Medicine | 2019 |
Genome-wide definition of selective sweeps reveals molecular evidence of trait-driven domestication among elite goat (Capra species) breeds for the production of dairy, cashmere, and meat | 选择性清除的全基因组定义揭示了优质山羊(Capra品种)品种为生产乳制品、羊绒和肉类而进行的性状驱动驯化的分子证据 | GigaScience | 2018 |
Colonic Lysine Homocysteinylation Induced by High-Fat Diet Suppresses DNA Damage Repair | 高脂肪饮食诱导的结肠赖氨酸同型半胱氨酸化抑制DNA损伤修复 | Cell Reports | 2018 |
Complex recombination with deletion in the F8 and duplication in the TMLHE mediated by int22h copies during early embryogenesis | 在早期胚胎发生过程中,由int22h拷贝介导的F8缺失和TMLHE复制的复杂重组 | Thrombosis and Haemostasis | 2017 |
Autism-like behaviours and germline transmission in transgenic monkeys overexpressing MeCP2 | 过表达MeCP2的转基因猴的自闭症样行为和种系传播 | Nature | 2016 |
1.AccuCopy通量如何?
答:AccuCopy多重检测可将12-16个片段融入1个检测体系,其中8-12个检测目的片段,3-4个参照基因片段。
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