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IF 10分的肿瘤m6A经典研究思路分享


    从2018年-2019年的m6A相关基金已经可以看出,短短一年多的时间,m6A的研究主题已经从图谱转向机制,尤其是肿瘤,心血管,免疫,干细胞这四个领域,简单的图谱已经无法打动基金审核的专家。图谱+机制的组合研究方案基本上已经是这几个领域5分以上文章的标配,今天小编就带大家阅读一篇眼科肿瘤的m6A文章,近期发表在Molecular Cancer杂志上,设计经典,思路清晰,一起来学习一下10分左右m6A文章的经典研究思路吧。

 

•    研究目标脉络膜黑色素瘤
•    研究团队上海交通大学医学院附属第九人民医院眼科范先群教授课题组与北京中科院基因所杨运桂教授课题组合作
•    期刊 Molecular Cancer(IF=10.679)

主要研究结果
 
 
 
 
 
 

 

除了提供m6A修饰整体水平定量,m6A图谱测序,m6A修饰目的基因表达水平定量服务
 
天昊为您的m6A研究思路做个小总结:

5分以下
思路:2个组别, RNA测序+ m6A-seq,确定m 6A整体水平差异,整体汇报 m6A-seq的修饰图谱,并且罗列差异表达基因和差异修饰基因。可能需要qpcr验证找到的差异基因。
 
5-8分
思路:2个组别,RNA测序+ m6A-seq,确定m6A整体水平差异,整体汇报 m6A-seq的修饰图谱,并且罗列差异表达基因和差异修饰基因。通过关键甲基化酶的细胞或动物敲降或过表达,结合后续的RNA表达谱或RNAseq数据变化,来确定受m6A调控表达的靶基因list;结合pcr验证部分靶基因。最好有临床数据结合分析。
 
10分左右
思路:除了完成基础的内容,比较关键是确定一个真正参与疾病,并且受m6A修饰调控的靶基因。核心内容包括4各方面:首先要将甲基化酶敲除或者过表达,体现关键甲基化酶表达变化对疾病表型的影响;其次要通过m6A图谱测序和RNA测序寻找一个真正参与疾病,并且受m6A修饰调控的靶基因,并且后续要利用功能试验证明靶基因真的与m6A修饰酶结合并受m6A修饰酶调控;最后需要将靶基因敲除或者过表达,体现这个关键靶基因表达变化对疾病表型的影响。

 



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