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2019国自然最全m6A RNA甲基化解析


    一年一度的国自然基金资助项目于上周放榜,各大平台陆续开始解析国自然项目内容,m6A RNA甲基化作为近三年来最火热的研究方向之一,国自然今年立项数目更是呈爆发式增长,天昊生物市场部从多个关键词入手,发现2019年m6A RNA甲基化项目共计179,比2018年增长了一倍之多。
 
从项目类型划分,重点项目3项,面上项目89项,青年基金81项,地区基金6项。


其中部分老师在相应的领域已经有m6A相关的重要成果发表:
 
 

    从科研单位划分,共计76个单位拿到了资助项目,中山大学在m6A领域仍然独占鳌头,拿到了20项,南京医科大学以17项占据次席,上海交通大学9项,华中科技大学7项,浙江大学6项,武汉大学6项,中南大学6项,哈尔滨医科大学5项,同济大学5项,郑州大学5项。
    中山大学在国内一直是m6A修饰表观领域的领跑者,作为第一单位或合作单位,2019年以来就有近26篇文章发表,其中包括1篇Nature (Histone H3 trimethylation at lysine 36 guides m6A RNA modification co-transcriptionally),1篇Cell Research (Transcriptome-wide reprogramming of N6-methyladenosine modification by the mouse microbiome),1篇Science Advances (Single-base mapping of m6A by an antibody-independent method),2篇Nature Communications和3篇Molecular Cancer。
 

    从研究方向划分,绝大多数项目都是与医学(健康或疾病)相关,农口相关的项目仅10项。医学疾病领域,肿瘤仍然是最主要的方向,约77项,最常见的包括肺癌、肝癌、胃癌、乳腺癌和结直肠癌等。研究的主要内容包括m6A修饰如何影响肿瘤的发生、增殖、转移、耐药等。
 

    其它主要的疾病方向包括心血管疾病(动脉粥样硬化、心肌梗死、心肌肥大、心肌炎症等共15项,部分如下图)、神经脊髓相关(11项)、骨相关(9项)、糖尿病(7项)、胚胎发育分化(7项)、孕期疾病(4项)、肺部疾病(3项)、脂肪代谢(3项)、肾脏疾病(3项)、脓毒症(2项)、银屑病(2项)等。
 

从研究思路上看,今年m6A RNA甲基化最大的特点是非编码RNA相关的内容大幅增加,医学相关共计47项!其中主要包括三个研究方向:
1. lncRNA或circRNA本身的m6A修饰
2. m6A修饰影响miRNA的成熟过程(primary miRNA的m6A修饰)
3. 非编码RNA作为上游因子调控m6A修饰相关的明星分子,从而影响某些mRNA的修饰
 

    比如m6A修饰影响miRNA的成熟过程,得益于2015年两项重要的奠基性的成果,1篇Nature和1篇Cell分别证实了m6A修饰能够影响miRNA的加工成熟过程以及发现了pri-miRNA m6A修饰的reader蛋白HNRNPA2B1。
 
 

    2019年以来国内学者在非编码RNA m6A修饰相关方向也有一些重要成果,如林东昕院士课题组发现吸烟能够通过m6A修饰的途径诱导miR-25-3p的成熟,从而促进胰腺癌的进展,相关成果于2019年4月发表在Nature Communications上。
 

    如中山大学药学院王红胜课题组发现m6A修饰的lncRNA RP11能够通过翻译后上调Zeb1蛋白的表达促进结直肠癌的进展,表明lncRNA的甲基化可能在结直肠癌中发挥重要作用,相关研究成果发表在2019年4月的Molecular Cancer上。
 

    总结近3年来m6A RNA甲基化修饰在疾病相关的各个领域都有新的重要的发现,m6A修饰确实参与到多种疾病的发生发展过程,而调控m6A修饰的因素众多,包括多种甲基化修饰酶(writers)、去甲基化修饰酶(erasers)、甲基化修饰识别蛋白(readers)、影响这些酶的上游因子等,同时各种RNA都有可能发生m6A修饰。因此RNA甲基化方向可以设计多种多样的方案,特别适合于国自然机制研究的胃口
 
关于天昊
天昊生物具有多年基因组、转录组和表观组等多组学检测与分析的经验,m6A RNA甲基化作为表观领域的一大热点,天昊生物可为您提供m6A整体水平定量,结合RNA-seqm6A MeRIP-seq挖掘潜在的受m6A调控酶影响的靶点,同时可对靶点进行MeRIP-qPCR验证。生信团队亦可提供个性化的数据库挖掘与生信分析内容。
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