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动物基因组研究常用数据库汇总(猪、羊、牛、马、鸡、小鼠等)


为了使大家高效的利用动物基因组数据库信息,更好的挑选感兴趣基因及变异数据用于后续研究,小编整理了一些常用数据库,供大家参考。

1、Animal QTLdb (猪、牛、羊、马、鸡等QTL信息)
网址:https://www.animalgenome.org/


2、Ensembl (比较基因组学、进化、序列变异和转录调控的研究网站)
网址:http://asia.ensembl.org/index.html
 

3、UCSC Genome Browser Gateway (各类动物基因组信息综合性网站)
网址:https://genome-asia.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway?redirect=manual&source=genome.ucsc.edu
 

4、Livestockgenomics数据库 (牛、羊基因组及SNP芯片数据)
网址:http://www.livestockgenomics.csiro.au/
 

5、Mammalian Annotation Database (人、牛、猪、马、兔子、狗、小鼠直系同源基因网站)
网址:https://madb.ethz.ch/
 

 
 

6、Mammalian Transcriptomic Database(MTD)(人、猪、小鼠、大鼠转录组信息)
网址:http://mtd.cbi.ac.cn/
 

7、LncRNAnet(关于猪、人、小鼠lncRNA的数据库)
网址:http://lnc.rnanet.org/
 

8、iSheep(关于羊的品种、基因和变异的数据平台)
网址:https://bigd.big.ac.cn/isheep/
 

9、ISCG (国际绵羊基因组学联合会,SNP芯片等数据)
网址:https://www.sheephapmap.org/
 

10、The Goat and Sheep DNA database
网址:https://www.itb.cnr.it/gosh/index.php
 

11、Goat Genome数据库(羊SNP芯片等数据)
网址:http://www.goatgenome.org/projects.html
 

12、Mouse Genome Informatics (小鼠基因组数据库)
网址:http://www.informatics.jax.org/
 

关于天昊
天昊生物可以提供多种动物基因检测及数据分析服务,我们利用自身研发的多项专利技术,包括SNPscan®高通量SNP分型技术、CNVplex®高通量DNA拷贝数检测技术、SSRseqTM超高通量SSR分型技术、MethylTarget®多重目的区域甲基化富集测序等技术,为您提供各种通量SNP基因分型分析、基因转录水平分析、甲基化水平分析等服务项目。同时还包括动物目的区域富集测序、全转录组测序、动物肠道16S/18S/ITS扩增子测序、宏基因组测序、线粒体基因组测序等成熟的科研分析服务。
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