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目的区域多重PCR富集测序

目的区域多重PCR富集测序

技术简介:

目的区域测序(Targeted Sequencing)是指针对感兴趣的目标区域富集后进行大规模测序。研究者可以针对自己感兴趣的染色体区域或者大量的候选基因区域进行数百个甚至上千个样品的序列测定。目前,天昊生物主要提供两种目的区域富集方法:定制液相芯片富集和FastTargetTM多重目的区域富集。
    FastTargetTM技术针对目的区域设计多重PCR扩增体系,对研究者感兴趣的基因组区域进行捕获富集。一个扩增反应体系可以完成16-20个PCR反应,直接获得4kb左右的基因组区域。该技术方法非常成熟,方法快速、操作简单,无需复杂的建库过程。后续,利用Illumina Hiseq测序仪的2×150bp测序模式对目的片段实现双向测序,对所获得测序数据进行生物信息学的读取、质控及分析,研究感兴趣的序列及序列差异。该方法非常适合< 200kb的多个候选基因外显子或连续区域富集二代测序项目。


技术参数及分析内容


技术优势


   • 针对性强:比起全基因组及全外显子组水平的研究,目的区域测序更具有针对性,可以依赖大量的前期研究成果,获得候选染色体区域或者基于生物通路的大量候选基因。
   • 费用低:目的待测区域较小,可对数百个样品进行快速测序,大大降低了研究成本。
   • 信息量大:比起目的区域或者候选基因单倍型标签SNP分型的研究策略,目的区域测序可以完整覆盖整个基因区域,不仅可以获得高频SNP的分型数据,而且还可以发现低频的和个体特有的变异。
   • 效率高:比起使用Sanger法的候选基因测序方法,基于二代测序技术的目的区域测序更加快速、高效。
   • 高精度:目的区域的高测序深度保证了更准确的测序结果。

技术参数及分析内容


技术路线



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