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肿瘤目的区域捕获测序

肿瘤目的区域捕获测序

技术简介:

肿瘤目的区域捕获测序是指通过对感兴趣的肿瘤目的基因进行富集后测序,为癌症研究提供了经济、省时、高效的研究策略。目前天昊生物提供两种目的区域捕获策略,基于多重PCR的FastTargetTM多重目的区域富集测序,和基于液相杂交的目的区域定制芯片捕获测序。
    FastTargetTM技术针对目的区域设计多重PCR扩增体系,对研究者感兴趣的基因组区域进行捕获富集。一个扩增反应体系可以完成16-20个PCR反应,直接获得4kb左右的基因组区域。该技术方法非常成熟,方法快速、操作简单,无需复杂的建库过程。后续,利用Illumina Hiseq测序仪的2×150bp测序模式对目的片段实现双向测序,对所获得测序数据进行生物信息学的读取、质控及分析,研究感兴趣的序列及序列差异。该方法非常适合< 200kb的多个候选基因外显子或连续区域富集二代测序项目。
    定制芯片富集方法利用商业Agilent SureSelect液相芯片富集捕获系统,定制目的区域的相关捕获探针,通过探针与样品片段化DNA的杂交和富集,将捕获之后洗涤获得的目的区域片段进行文库构建,扩增后利用Illumina Hiseq 高通量二代测序系统进行PE150的测序,对所获得测序数据进行生物信息学的读取、质控及分析,研究感兴趣的序列及序列差异。该方法非常适合100kb-12Mb区域的多个候选基因外显子或连续区域富集二代测序项目。


技术参数及分析内容


技术优势


   • 目的区域测序花费更小、效率更高
   • 针对性更强,结果更容易解释
   • 可以实现更深的测序深度,更容易发现罕见变异

技术参数及分析内容




技术路线



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